主线是叶月在她的那个世界里面爱上了和自己一起生活的初美,但初没在16岁生日的时候突然消失了,叶月便在那个黄不点的带领下来到了大图书馆,这里她遇上了lilith,lilith看她和yamiyama长得很像,立即喜欢上了她,这里叶月知道了初美原来就是eve,也知道了初美现在在某个世界里面,于是她们便一起开始在各个不同的世界找初美,在每个世界里面都有一个相对独立的小故事,这里的世界有了上面的夜行列车的世界,原始人的世界,小岛,竹林的世界,太空飞船的世界,最后在空间领域的世界里面碰到了eve………… 
另外一条线索是有关那个格尔刚裘呀的故事,是以回忆的形式零散地分布在全片中,最遥远的是他小时候和吉尔的故事,他误杀了eve ,后面就是他和公主的故事,以及他和lilith的故事,最后他到了自己的世界——古堡,然后他每天都在想找到eve,不停地责备那3个小鬼无能,最后他误闯入空间领域的世界,这里他以外碰到了公主,也碰到了eve……